Pierwszy miesiąc nowego roku szkolnego poświęcony został sprawom organizacyjnym.

W dniach 20-27 września delegacja nauczycieli w składzie: Janusz Zieliński, dyrektor szkoły, Barbara Głuszcz, koordynator projektu, Zofia Ożlańska i Małgorzata Puchalska wzięła udział w spotkaniu roboczym w Estonii. W czasie spotkania, którego gospodarzem była Szkoła Podstawowa w Tormie, przedstawiciele wszystkich szkół partnerskich opracowali szczegółowy harmonogram wspólnych działań związanych z projektem, dyskutowali o swoich problemach oraz zastanawiali się nad sposobami ich rozwiązania. Była to również doskonała okazja, aby podzielić się swoimi doświadczeniami. Nasi estońscy gospodarze zadbali o ciekawy program wizyty. Przyglądaliśmy się pracy uczniów miejscowej szkoły, obserwowaliśmy zabawy przedszkolaków, a w czasie licznych rozmów z estońskimi nauczycielami porównywaliśmy systemy oświatowe naszych krajów. Wzięliśmy też udział w spotkaniu z przedstawicielem władz lokalnych. Zwiedziliśmy nie tylko dwa największe miasta Estonii, Tallin i Tartu, ale również wiele innych uroczych miejsc. Podziwialiśmy wodospad Jägala i zamek Rakvere. Odwiedziliśmy ważniejsze miejscowości regionu Jõgeva: Laiuse, Kuremaa, Palamuse, Kassinurme oraz Park Dzikiej Fauny i Flory Elistvere.

Po powrocie z Estonii opracowany został plan pracy zespołu Comeniusa na rok szkolny 2008/2009.

Obyło się też pierwsze spotkanie zespołu uczniów, którzy najbardziej zaangażowani są w realizację projektu i czuwają nad jego sprawnym przebiegiem. Uczniowie wysłuchali relacji Barbary Głuszcz z wizyty w Estonii. Mieli okazję, aby skosztować estońskich słodyczy. Następnie uczniowie wybrali swojego przewodniczącego, którym została Anita Grabowska z klasy VI a, oraz zapoznali się z planami na bieżący rok szkolny.

Agata Czarniakowska i Barbara Głuszcz zajęły się również rejestracją szkoły i produktów końcowych w Bazie EST, która zgodnie z wymaganiami Agencji Narodowej przeprowadzona  została w dwóch wersjach językowych.

W Kąciku Comeniusa pojawiły się  zwroty "Witaj szkoło!" w językach krajów partnerskich oraz informacje na temat ich systemów oświatowych.